Margarete Schweikert ist in Karlsruhe geboren. Sie erhielt zunächst von den Eltern Violin- und Klavierunterricht, und zum Schuljahr 1898/99 wurde sie Schülerin am neu gegründeten Munz'schen Konservatorium in Karlsruhe. Hier wurden auch ab 1904 in den öffentlichen Schülerkonzerten ihre ersten Kompositionen aufgeführt - neben einigen Liedern der symphonisch angelegte 57. Psalm für Solosopran, Chor und Orchester. Zum Schuljahr 1906/07 trat sie an das Badische Konservatorium über, wo sie Unterricht in den Fächern Violine, Musiktheorie und Komposition nahm und später einmal selbst unterrichten sollte. Zur Volljährigkeit ließ sie sich anstatt einer Aussteuer eine Violine von ihren Eltern schenken.

Etwa 100 Lieder hat Margarete Schweikert komponiert, mehrere Klavier- und Orgelstücke sowie kammermusikalische Werke stammen von ihr. Diese Kompositionen wurden vor allem in Karlsruhe aufgeführt und erfuhren dabei ebenso Beachtung in der Presse wie das Singspiel für Kinder Der Froschkönig, das 1914/15 mehrfach am Großherzoglichen Theater gegeben wurde.

Bedeutende Verdienste hat Margarete Schweikert als Interpretin und Pädagogin erlangt. Sie konzertierte mit fremden und eigenen Kompositionen als Geigerin im ganzen südwestdeutschen Raum, außerdem wirkte sie als Musikkritikerin bei Konzerten und Opernaufführungen für die Karlsruher Presse. Sehr bekannt wurde sie für ihre Interpretation von Werken Max Regers, eine Konzertreise 1920/21 mit dem Pianisten und Reger-Freund August Schmid-Lindner führte sie nach Frankfurt, München, Nürnberg, Stuttgart, Würzburg und Berlin. In der durch Inflation und wirtschaftliche Regression schwierigen Zeit veranstaltete Margarete Schweikert in der Wohnung der Eltern in der Douglasstraße 7 eine eigene Konzertreihe, die auch großes Echo in der Presse fand.

1923 heiratete die Komponistin Hermann Voigt, ein Jahr später kam ihre Tochter Christiane auf die Welt. Im Dritten Reich traf Margarete Schweikert das Berufsverbot für Doppelverdiener, einzig eine ehrenamtliche Tätigkeit - wie bei den Heimabenden der NS-Frauengemeinschaft - durfte sie ausüben. Im Jahr 1950 wurde sie Mitbegründerin der GEDOK (Verband der Gemeinschaften deutscher und österreichischer Künstlerinnen e. V.), deren Vorsitzende im Ortsverband Karlsruhe sie wurde. 1957 erlag sie einem Krebsleiden.

Ihr musikalischer Nachlass, der nach dem Ende des Zweiten Weltkriegs aus einem Luftschutzkeller in Backnang gerettet werden konnte, blieb - nur durch einen Wasserschaden leicht beschädigt - glücklicherweise erhalten. Er wird seit 2004 in der Badischen Landesbibliothek Karlsruhe verwahrt.