Jochen Johannsen studierte Geschichte, Osteuropäische Geschichte und Germanistik an den Universitäten Freiburg im Breisgau und Köln, sowie Bibliothekswissenschaft an der Humboldt Universität Berlin. 2004 Promotion an der Universität Witten Herdecke mit einer Arbeit über Geschichtsphilosophie und Historische Anthropologie bei Johann Gottfried Herder. Der Abschluss als Master of Arts (Library and Information Science) folgte 2005.

Nach Tätigkeiten an der Zentralbibliothek der Deutschen Sporthochschule Köln und der Universitätsbibliothek der TU Berlin arbeitete er von 2006 bis 2011 am Hochschulbibliothekszentrum des Landes Nordrhein-Westfalen in Köln (hbz) und war dort seit 2008 als Leiter der Gruppe "Digitale Inhalte" verantwortlich für die landes- und bundesweite konsortiale Erwerbung von E-Medien.

Er ist seit 2009 Mitglied in der Kommission "Erwerbung und Bestandsentwicklung" des Deutschen Bibliotheksverbandes (dbv). Seit Januar 2012 Leiter der Abteilung Bestandsaufbau an der Badischen Landesbibliothek, sowie Übernahme von Fachreferaten.